2020年3月经广西科学院党组批准，广西科学院防城港分院成立，与北部湾海洋产业研究院实行一套人马、两块牌子。北部湾海洋产业研究院于2019年11月19日正式揭牌，是广西科学院与防城港市共建的由产学研多方参与的新型研发机构，集产业共性技术和关键技术研发、成果转化、企业孵化、技术服务于一体，以产业化应用为目标，自主经营、自负盈亏的独立法人组织，北部湾海洋产业研究院实行理事会领导下的院长负责制。
1、内设机构
管理部门：行政事业部、项目管理部、财务部、产业管理部。
研究部门：海水养殖研发中心、海洋生态与资源研发中心、先进技术研发中心、智慧海洋研究中心、海洋环境技术研发中心、生物医药与健康研发中心、生态环保所。
研究基地：珍珠湾滨海生态实验站、海洋生态环境保护试验基地、海水养殖产业示范基地。
2、创新平台
按“小机构、大平台、大人才、大产业”的建设思路，整合双方利用多方创新平台资源，创新科技管理与运行机制，搭建可服务地方经济发展的北部湾海洋产业与生态环境创新平台。
3、方向与目标
方向：面向需求，以广西北部湾经济区的需求为导向，面向海洋产业、大健康产业、新一代信息技术、生态环保产业等产业的需求，组织广西科学院及区内外专家为北部湾海洋生态文明建设和产业高质量发展服务；开放合作，坚持“目标引领、人才汇聚、协同创新、产业落地”的办院方针，强化开放合作，汇聚各类创新资源协同创新，切实为产业高质量发展提供科技支撑。
目标：围绕海洋牧场、海水健康养殖、海洋生态保护与资源开发、渔港装备先进制造、大数据与智慧海洋、大健康产业等领域，通过项目合作、人才交流、成果转化，三年到五年内建立产业技术研发与转化平台，集聚一批高水平的科技人才和团队，建成解决北部湾区域海洋产业重大技术问题的创新高地。
4、优势领域和技术
（1）海水养殖研发中心：海水养殖经济品种苗种繁育、海水养殖新品种开发、海洋生物种质资源与遗传育种、海水健康养殖技术、近海生物资源养护与生态修复基础与技术，建有集育苗、中培和养殖示范于一体的海水增养殖中试基地，长期以来为广西耕渔牧海构建向海经济的现代化产业体系提供技术支持，助力广西海洋经济的高质量发展。目前的优质产品和技术包括方格星虫（沙虫）、青蟹、象鼻螺，方斑东风螺、中国鲎、金鲳鱼、石斑鱼、墨吉对虾、长毛对虾等的人工育苗和养殖技术创新及应用。
（2）海洋生态与资源研发中心：红树林、海草和珊瑚礁生态修复、监测与评价技术；滨海湿地资源保护与合理利用创意；生态海堤，纳潮红树林生态混养，地埋管网红树林原位生态养殖，“林贝青”海水生物净化装置，养殖污染物再利用等可持续利用技术。具有自主知识产权的“红树林滨海湿地生态一体化保育”模式及技术，成为践行习近平总书记“绿水青山就是金山银山”理论的范例。原创性提出、概念设计并参与建设完成的全国首条红树林生态海堤——防城港市东湾红沙环生态海堤。
（3）先进技术研发中心：北部湾海洋微生物、藻类、植物等来源新型生物制品（海洋生物功能食品、海洋生物活性日化产品、海洋生物酶制剂、海洋生物农药）和海洋医疗材料创制和高值化加工绿色制造技术；海洋观测仪器、循环水养殖信息管理与智能化控制设备等海洋仪器设备研发和应用；海洋生态灾害监测、预警与防控技术及装备研发和应用；水生生物病害防控新技术和应用；科普+旅游+产业模式创建及新信息技术研发和应用。
（4）智慧海洋研究中心：以人工智能、大数据技术与海洋物联网的深度融合，构建地方海洋大数据平台，面向政府海洋主管部门、涉海涉渔的企业与个人，统一标准建设智慧海洋综合管理平台，涵盖海洋环境保护、海洋资源开发、渔业资源利用、海域海岛管理、海洋防灾减灾等多个领域。目前建立的海洋牧场水下综合位置服务装备体系，应用于在钦州茅尾海和北海铁山港；创建钦州大蚝淘宝、京东、抖音和直播平台，建立钦州大蚝差异化电商品牌，直接服务北部湾地区2000多家蚝农和中介代理商，取得较好经济和社会效益，可以推广到北部湾、我国沿海，并辐射越南、泰国等东盟国家。
（5）海洋环境技术研发中心：主要开展北部湾海洋环境质量监测与评估技术、海洋污染控制与生态修复技术等方面的技术研发及应用。相关成果已在海洋和水产等部门采用：海水养殖水质生物絮团技术在越南水产研究院、广西精工海产养殖公司等推广应用；海洋污染应急技术及授权发明专利（溢油栏、重金属吸附剂）等成果被广西环保、海洋管理等部门应用。系列研究成果为北部湾经济开发规划布局与管理、海洋资源合理开发利用提供了科学依据，也为中国-东盟北部湾海洋污染事故仲裁与处置等国际环境外交提供技术支撑。
（6）生物医药与健康研发中心：功能性海洋微生物菌种资源库的研发应用；海洋活性物质的分离、提取及合成、半合成技术；基于海洋活性成分的先导化合物的筛选及成药性评价；基于广西特色壮/瑶药经典方或验方药效物质基础、活性功能成分挖掘等研发海洋中药或制剂；金花茶和药用植物大健康产品的研发；化合物结构分析、药品成分定性定量、保健食品和药物功效成分检测、溶剂残留及添加剂检测。
（7）生态环保所：生态环境修复技术研发及应用；生态环保科技产品研发；海洋水体生态修复技术应用及研究；城市黑臭水体治理技术研究；环境影响评价报告编制；水土保持方案报告编制；高浓度工业废水技术应用及治理，环保工程设计及施工。
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